Il MuSa, è ospitato negli spazi della chiesa e del collegio somasco di Santa Giustina fondato nel 1587.

L'ex convento dell'ordine i Somaschi nel XVII secolo, già Collegio Civico di Salò e successivamente utilizzato come sede della Guardia Nazionale dalla Repubblica Fascista di Salò, grazie alla collaborazione tra pubblico e privati è stato convertito verso il nuovo Polo Museale di Salò. In questo centro trovano spazio il museo archeologico, un museo dedicato alla storia degli strumenti a corda- liuteria (con la ricostruzione della bottega di Gasparo di Salò, l'inventore del violino) e un'esposizione di storia militare con cimeli napoleonici e della terza guerra di indipendenza.